Lý lịch khoa học - Phạm Minh Quân

THÔNG TIN CÁ NHÂN

Họ và tên: Phạm Minh Quân

Chức vụ: Phó Viện trưởng, Phó Giám đốc Trung tâm

Học hàm, học vị : Phó Giáo sư, Tiến sĩ, Nghiên cứu viên chính

Điện thoại: 0987481589

Email: pham-minh.quan@inpc.vast.vn / minhquanaries@gmail.com

 

LĨNH VỰC CHUYÊN MÔN

  • Phân lập, xác định cấu trúc và bán tổng hợp các hợp chất thiên nhiên có hoạt tính sinh học.
  • Tìm kiếm nguồn hoạt chất mới từ cơ sở dữ liệu các hợp chất thiên nhiên của Việt Nam.
  • Tìm kiếm và nghiên cứu phát triển thuốc mới sử dụng công cụ hỗ trợ máy tính.

CÔNG BỐ 3 NĂM GẦN NHẤT

I. Tạp chí Quốc tế

1. Son Tung Ngo, Nguyen Minh Tam, Minh Quan Pham, Trung Hai Nguyen. “A benchmark of popular free energy approaches revealing the inhibitors binding to SARS-CoV2 Mpro”, Journal of Chemical Informatio n and Modeling, 1549-9596, 2021.

2. Cao Duc Tuan, Doan Thi Mai Huong, Pham Van Cuong, Hoang Thi Hong Lien, Jung-Woo Chae, Hwi-yeol Yun, Min-Kyun Na, Young-Ho Kim, Pham Minh Quan, Nguyen Van Hung. “Molecular design of anticancer drug from marine fungi derivatives”, marine fungi derivatives RSC Advances, 2046-2069, 2021.

3. Nguyen Minh Tam, Pham Minh Quan, Nguyen Xuan Ha, Pham Cam Nam, Phung Thi Thu Huong. “Computational estimation of potential inhibitors from the known drugs against the main protease of SARS-CoV-2”, RSC Advances, 2046-2069, 2021.

4. Dinh Thi Kim Hoa, Nguyen Phi Hung, Doan Lan Phuong, Dang Thi Phuong Ly, Pham Minh Quan, Dao Thi Kim Dung, Valeria Grigorchuk, Pham Quoc Long. “Component and content of Lipid classes and Phospholipid molecular species of egg and body of the Vietnamese sea urchin Tripneustes gratilla”, Molecules, Vol 28, No.9, P.3721, 1420-3049, 2023.

5. Phung Thi Thu Huong, Nguyen Minh Tam, Tran Hoang Linh, Vo Van Quan, Pham Minh Quan. “Designing Potential Inhibitors of SARS-CoV-2 Mpro Using Deep-Learning and Steered-Molecular Dynamic Simulations”, Journal of Computati onal Biophysics and Chemistry, 2737-4173, 2023.

6. Phuong Hong Nguyen, Bui Thi Buu Hue, Minh Quan Pham, Tran Phuong Hoa, Tran Quang De, Jung Hosun, Le Trong Hieu, Nguyen Cuong Quoc, Hong Vinh Quang, Nguyen Phu Quy, Yang Sugeun. “Novel histone deacetylase 6 inhibitors using benzimidazole as caps for cancer treatment”, New Journal of Chemistry, 1144-0546,2023.

7. Hang Nguyen Thi Thuy, Anh Nguyen Le, Minh Quan Pham, Binh Vo Ngoc, Quoc Anh Ngo. “Multicomponent Synthesis of New 5- thiourea-4-aza-2,3 didehydropodophyllot oxins as Potent Cytotoxic Agents”, Journal of Heterocycl ic Chemistry, Vol 60, No.5, P. 834-846, 0022-152X, 2023.

8. Nguyen Thi Thu Huyen, Nguyen Ngoc Anh Tho, Nguyen Hai Dang, Nguyen Thi Thu Hien, Le Mai Huong, Pham Minh Quan, Do Huu Nghi, Hoang Kim Chi, Michalet Serge, Marie-Genevieve, Dijoux-Franca, Pham Hoang Nam. “Plant secondary metabolites on efflux-mediated antibiotic resistant Stenotrophomonas maltophillia: potential of herbal-derived efflux pump inhibitors”, Antibiotics , Vol 12, No.2, P.421, 2079 – 6382, 2023.

9. Trung Hai Nguyen, Quynh Mai Thai, Minh Quan Pham, Pham Thi Hong Minh, Huong Thi Thu Phung. “Machine learning combines atomistic simulations to predict SARS-CoV-2 Mpro inhibitors from natural compounds”, Molecular Diversity, 1573-501X, 2023.

10. Nguyen Huy Hung, Pham Minh Quan, Do Ngoc Dai, Prabodh Satyal, Le Thi Huong, Le Duc Giang, Le Thanh Hung, William N. Setzer. “Environmentally-friendly pesticidal activities of Callicarpa and Karomia essential oils from Vietnam and their Microemulsions”, Chemistry & Biodiversit y, Vol 20, 1612-1872, 2023.

11. Sabiha Mehmood, Noshin Ilyas, Nosheen Akhtar, Wen Yi Chia, Ali A. Shati, Mohammad Y. Alfaifi, R. Z. Sayyed, Yustina M Pusparizkita, Heli Siti Halimatul Munawaroh, Pham Minh Quan, Pau Loke Show. “Structural Breakdown and Phytotoxic Assessments of Polyethylene Degradation through Acid Hydrolysis, Starch Addition and Pseudomonas aeruginosa Bioremediation”, Environme ntal Research, Vol 217, P.114784, 0013 - 9351, 2023.

12. Quynh Mai Thai, Pham Thi Ngoc Han, Dinh Minh Hiep, Minh Quan Pham, Phuong Thao Tran, Trung Hai Nguyen, Son Tung Ngo. “Searching for AChE inhibitors from natural compounds by using machine learning and atomistic simulations”, Journal of Molecular Graphics and Modelling, Vol 115, 108230, 1873-4243, 2022.

13. Son Tung Ngo, Trung Hai Nguyen, Nguyen Thanh Tung, Van V. Vu, Minh Quan Pham, Binh Khanh Mai. “Characterizing the ligand-binding affinity to SARS-CoV-2 Mpro via physics and knowledge based approaches”, Physical Chemistry Chemical Physics, Vol 24, No.48, P.29266-2 9278, 1463-9076, 2022.

14. Nguyen Thi Thuy, Pham Minh Quan, Pham Quoc Long, Dao Thi Kim Dung, Nguyen Thi Mai, Duong The Vi, Nguyen Thi Diep, Doan Lan Phuong. “Study on lipid and phospholipid composition from the seed oil of Dalbergia tonkinensis”, Vietnam Journal of Science and Technology, 2023.

15. Le Thi Khanh Linh, Pham Quoc Long, Pham Thi Hong Minh, Le Thi Phuong Hoa, Pham Minh Quan, Dang Ngoc Quang. “Potential wMUS81 inhibitory activity of triterpenoids isolated from Helicteres hirsuta and Pterospermum truncatolobatum revealed by molecular docking simulation”, Vietnam Journal of Chemistry, 2023.

16. Pham Cao Bach, Tran Thi Tuyen, Do Huu Nghi, Hoang Thi Bich, Trinh Anh Vien, Pham Minh Quan, Tran Quoc Toan, Dinh Thi Thu Thuy, Nguyen Thi Thuy, Cam Thi Inh, Pham Thi Hong Minh, Nguyen Thi Hong Van. “Chemical constituents and biological activities of the seed essential oil from Michelia tonkinensis grown in Thanh Hoa province, Vietnam”, Vietnam Journal of Chemistry, 2023

II. Tạp chí trong nước

1. Pham Minh Quan, Le Thi Thuy Huong, Pham Thi Hong Minh, Tran Quoc Toan, Do Tien Lam, Vu Thi Thu Le, Pham Quoc Long. “Autodock 4.2.6 as an effective tool for molecular docking studies against SARSCoV-2 main protease: A tutorial using MGLTOOLS”, Vietnam Journal of Science and Technolog y, Vol 60, N.6, P.929-947, 2022.

2. Nguyen Xuan Ha, Vu Thi Thu Le, Do Tien Lam, Pham Minh Quan, Vu Thanh Dat. “Evaluation of anti-inflammatory compounds isolated from Millettia Dielsiana Harms ex Diels by molecular docking method”, Vietnam Journal of Science and Technolog y, Vol 60, N.5, P.785-793, 2022

3. Thi Thuy Nguyen, Thi Ngoc Anh Hoang, Thi Thuy Huong Le, Dinh Hieu Truong, Minh Quan Pham, Quoc Long Pham, Manh Cuong Nguyen, Lan Phuong Doan, Duy Quang Dao. “Antioxidant potential of eight phenolic acids by using high performance density functional theory”, Vietnam Journal of Science and Technolog y, Vol 60, N.1, P.21-32, 2022.

4. Thi Thuy Huong Le, Dinh Hieu Truong, Thi Le Anh Nguyen, Pham Minh Quan, Thi Chinh Ngo, Duy Quang Dao. “SERS chemical enhancement of 2,4,5- Trichlorophenoxyacet ic acid absorbed on Au20, its Au-Ag and Au-Cu bimetallic clusters: A DFT study”, Vietnam Journal of Science and Technolog y, Vol 60, N.4, P.641-651, 2022.

5. Pham Thi Hai Ha, Tran Kien Cuong, Nguyen Thi Thu Nha, Nguyen Phan Hoang Lan, Nguyen Huu Thuan Anh, Bach Long Giang, Pham Minh Quan, Tran Quoc Toan, Pham Quoc Long, Nguyen Thanh Luan. “A study on biological activities of Bouea macrophylla Griff leaf extract”, Vietnam Journal of Biotechnol ogy, Vol 20, N.2, P.339-349, 2022.

6. Dao Thi Kim Dung, Pham Minh Quan, Pham Quoc Long, Nguyen Thi Nga, Dinh Thi Tu, Sikorskaya T. V., Ermolenko E. V., Dang Thi Phuong Ly, Nguyen Anh Hung. “Study on the year-round fluctuation of total lipid content and lipid classes composition in soft coral Sinularia flexibilis from Nha Trang, Khanh Hoa coastal”, Vietnam Journal of Marine Science and Technolog y, Vol 22, N.1, P. 59-65, 2022.

7. Nguyen Thi Thuy, Dang Thi Minh Tuyet, Dao Thi Kim Dung, Pham Minh Quan, Pham Quoc Long, Nguyen Thi Mai, Lanh Thi Ngoc, Doan Lan Phuong. “Research of fatty acids, tocopherols and sterols of seed oils extracted from Pachyrhizus erosus (L. Urb.) in Vietnam”, Vietnam Journal of Science and Technology, 2020.

8. Vu Thi Thu Le, Dao Viet Hung, Ha Viet Hai, Do Huu Nghi, Pham Minh Quan. “otential Mortalin-p53 complex abrogation of ent-kaurane diterpenoids from Croton tonkinensis revealed by homology modeling and docking simulation”, Vietnam Journal of Science and Technology, 2020.

9. Tran Thi Hoai Van, Pham Thi Hong Minh, Pham Quoc Long, Do Tien Lam, Ha Viet Hai, Le Thi Thuy Huong, Le Duc Anh, Pham Minh Quan. “Effect of some phytoflavonoids and terpenoid on proline metabolism of Vibrio Parahaemolyicus: Inhibitory mechanism and interaction with molecular docking simulation”, Vietnam Journal of Science and Technology, 2020.

SÁNG CHẾ, GIẢI PHÁP HỮU ÍCH

1. Bằng độc quyền sáng chế số 18377: "Hợp chất (24S)-28-O-[beta-D-galactofucopyranosyl-(1-5)-alpha-L-arabinofuranosyl]-24-metyl-5alpha-cholestan-3beta,4beta,6alpha,8,15beta,28-heptol và phương pháp phân lập hợp chất này từ loài sao biển Acanthaster Planci", cấp theo Quyết định số 6820/QĐ-SHTT.

2. Bằng độc quyền giải pháp hữu ích số 1637: "Hợp chất (24S)-28-O-[alpha-L-fucopyranosyl-(1-2)-3-O-metyl-beta-D-xylopyranosyl]-24-metyl-5alpha-cholestan-3beta,4beta,6alpha,8,15beta,16beta,28-heptol và [(24S)-28-O-[2,4-di-O-metyl-beta-D-xylopyranosyl-(1-2)-alpha-L-arabinofuranosyl]-24-metyl-5alpha-cholestan-3beta,4beta,6alpha,8,15,16beta,28-heptol] 6-O-sulfat và phương pháp phân lập hai hợp chất này từ loài sao biển Acanthaster Planci", cấp theo Quyết định số 4539/QĐ-SHTT.

3. Bằng độc quyền giải pháp hữu ích số 2599: "Quy trình sản xuất chế phẩm giàu phospholipit chứa các axit béo họ eicosanoit từ hàu biển (Oyster sp.)", cấp theo Quyết định số 3702w/QĐ-SHTT.

4. Bằng độc quyền giải pháp hữu ích số 2606: "Quy trình chế biến rong mơ (Sargassum sp.) để thu các sản phẩm fucoxanthin, phlorotanin, fucoidan và alginat theo phương pháp sử dụng sóng siêu âm cường độ cao kết hợp enzym", cấp theo Quyết định số 3750w/QĐ-SHTT.

5. Bằng độc quyền sáng chế số 28816: "Quy trình phân lập và tinh chế hợp chất 1-metoxy-3-metyl-9H-carbazol từ rễ cây cơm rượu trái hẹp (Glycosmis stenocarpa)", cấp theo Quyết định số 9209w/QĐ-SHTT.

SÁCH

1. Doan Lan Phuong, Pham Minh Quan, La Dinh Moi, Nguyen Quoc Binh, Bertrand Matthaeus, Pham Quoc Long (2018). Lipit từ hạt một số loài thực vật Việt Nam. Nhà Xuất bản Khoa học tự nhiên và Công nghệ. ISBN: 978-604-913-744-0.

2. Nguyen Xuan Nhiem, Pham Minh Quan, Nguyen Thi Hong Van (2020). Alkaloids and Their Pharmacology Effects from Zanthoxylum Genus. IntechOpen, ISBN: 978-1-83880-888-4.

3. Nguyen Thi Hong Van, Pham Minh Quan, Trinh Anh Vien, Pham Cao Bach, Pham Quoc Long (2021). Thành phần hóa học và hoạt tính sinh học của một số loài Ardisia thuộc họ Myrsinaceae ở Việt Nam. Nhà Xuất bản Khoa học tự nhiên và Công nghệ. ISBN: 978-604-9988-43-1.

4. Ngo Son Tung, Pham Minh Quan (2022). Umbrella Sampling-Based Method to Compute Ligand-Binding Affinity. SpringerLink - Humana New York, NY, ISSN: 1940-6029, ISBN: 978-1-0716-1766-3.

5. Nguyen Thi Ai Nhung, Tran Thi Ai My, Minh Quan Pham, Phi Hung Nguyen, Dao Cuong To (2022). Compounds from Isodon ternifolius and their Cytotoxic Activity. Book Chapter of " Cutting Edge Research in Biology Vol. 2". B P International. https://doi.org/10.9734/bpi/cerb/v2/8915F.

6. Pham Minh Quan, Ngo Son Tung, Pham Quoc Long (2022). Giới thiệu về thiết kế thuốc sử dụng công cụ hỗ trợ máy tính. Nhà Xuất bản Khoa học tự nhiên và Công nghệ. ISBN: 987-604-357-090-8.

BẰNG KHEN

1. Bằng khen của Bộ trưởng Bộ Khoa học và Công nghệ - QĐ số 3233/QĐ-BKHCN, ngày 09/12/2021 của Bộ trưởng Bộ Khoa học và Công nghệ.

2. Bằng khen của Chủ tịch Ủy ban nhân dân thành phố Hà Nội - QĐ số 1687/QĐ-UBND ngày 22/3/2023 của Chủ tịch Ủy ban nhân dân thành phố Hà Nội.

3. Bằng khen của Chủ tịch Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam - QĐ số 994/QĐ-VHL ngày 7/6/2023 của Chủ tịch Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam.